MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 134693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009767	TCT	2	6	198	203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009767	CTC	2	6	264	269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009767	GCTG	2	8	282	289	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009767	AGG	2	6	334	339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009767	ACA	2	6	437	442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740029
6	NC_009767	TCGATA	2	12	467	478	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156740029
7	NC_009767	CG	3	6	496	501	0 %	0 %	50 %	50 %	156740029
8	NC_009767	TCA	2	6	512	517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740029
9	NC_009767	AAG	2	6	518	523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740029
10	NC_009767	GTC	2	6	571	576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740029
11	NC_009767	GTCTGA	2	12	612	623	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156740029
12	NC_009767	GGCA	2	8	649	656	25 %	0 %	50 %	25 %	156740029
13	NC_009767	GC	3	6	738	743	0 %	0 %	50 %	50 %	156740029
14	NC_009767	TCA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740029
15	NC_009767	GGC	2	6	910	915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740029
16	NC_009767	CAG	2	6	1045	1050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740029
17	NC_009767	GAG	2	6	1054	1059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156740029
18	NC_009767	CTG	2	6	1090	1095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740029
19	NC_009767	TGA	2	6	1098	1103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740029
20	NC_009767	GAA	2	6	1138	1143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740029
21	NC_009767	T	6	6	1144	1149	0 %	100 %	0 %	0 %	156740029
22	NC_009767	ATC	2	6	1186	1191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740029
23	NC_009767	ATCGG	2	10	1197	1206	20 %	20 %	40 %	20 %	156740029
24	NC_009767	GAA	2	6	1231	1236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740029
25	NC_009767	TCG	2	6	1268	1273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740029
26	NC_009767	GC	3	6	1314	1319	0 %	0 %	50 %	50 %	156740029
27	NC_009767	TGAT	2	8	1358	1365	25 %	50 %	25 %	0 %	156740029
28	NC_009767	GCG	2	6	1549	1554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740029
29	NC_009767	CTCC	2	8	1575	1582	0 %	25 %	0 %	75 %	156740029
30	NC_009767	GAG	2	6	1645	1650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156740029
31	NC_009767	GGT	2	6	1687	1692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740029
32	NC_009767	ACG	2	6	1702	1707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740029
33	NC_009767	TGA	2	6	1793	1798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740029
34	NC_009767	GCC	2	6	1837	1842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_009767	TCA	2	6	1874	1879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009767	CTC	2	6	1907	1912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_009767	GAT	2	6	1922	1927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740030
38	NC_009767	GCT	2	6	1942	1947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740030
39	NC_009767	GCT	2	6	1994	1999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740030
40	NC_009767	CGG	2	6	2069	2074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740030
41	NC_009767	CCG	2	6	2080	2085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740030
42	NC_009767	GTG	2	6	2162	2167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740030
43	NC_009767	TAC	2	6	2169	2174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740030
44	NC_009767	AGGC	2	8	2198	2205	25 %	0 %	50 %	25 %	156740030
45	NC_009767	CGG	2	6	2324	2329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740030
46	NC_009767	CTGG	2	8	2405	2412	0 %	25 %	50 %	25 %	156740030
47	NC_009767	CGC	2	6	2465	2470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740030
48	NC_009767	GGC	2	6	2501	2506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740030
49	NC_009767	CCG	2	6	2514	2519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740030
50	NC_009767	AGA	2	6	2548	2553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740030
51	NC_009767	CGT	2	6	2572	2577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740030
52	NC_009767	ACT	3	9	2578	2586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740030
53	NC_009767	TGGA	2	8	2658	2665	25 %	25 %	50 %	0 %	156740030
54	NC_009767	GC	3	6	2683	2688	0 %	0 %	50 %	50 %	156740030
55	NC_009767	GCG	2	6	2826	2831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740030
56	NC_009767	GAT	2	6	2847	2852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740030
57	NC_009767	GCG	2	6	2893	2898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740030
58	NC_009767	CGC	2	6	2959	2964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740030
59	NC_009767	CAGA	2	8	3076	3083	50 %	0 %	25 %	25 %	156740030
60	NC_009767	CTA	2	6	3151	3156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740031
61	NC_009767	CGT	2	6	3178	3183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740031
62	NC_009767	AATC	2	8	3266	3273	50 %	25 %	0 %	25 %	156740031
63	NC_009767	TAC	2	6	3278	3283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740031
64	NC_009767	TCG	2	6	3285	3290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740031
65	NC_009767	GC	3	6	3316	3321	0 %	0 %	50 %	50 %	156740031
66	NC_009767	GTT	2	6	3347	3352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156740031
67	NC_009767	GTT	2	6	3385	3390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156740031
68	NC_009767	AGC	2	6	3393	3398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740031
69	NC_009767	CAC	2	6	3564	3569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740032
70	NC_009767	CGGG	2	8	3593	3600	0 %	0 %	75 %	25 %	156740032
71	NC_009767	CGG	2	6	3609	3614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740032
72	NC_009767	GTA	2	6	3674	3679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740032
73	NC_009767	GAG	2	6	3705	3710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156740032
74	NC_009767	TTTC	2	8	3810	3817	0 %	75 %	0 %	25 %	156740032
75	NC_009767	CCT	2	6	3871	3876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156740032
76	NC_009767	GCG	2	6	3892	3897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740032
77	NC_009767	CGG	2	6	3935	3940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740032
78	NC_009767	CGT	3	9	3953	3961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740032
79	NC_009767	CAGG	2	8	3967	3974	25 %	0 %	50 %	25 %	156740033
80	NC_009767	CAG	5	15	4047	4061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740033
81	NC_009767	AGC	3	9	4066	4074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740033
82	NC_009767	CG	3	6	4093	4098	0 %	0 %	50 %	50 %	156740033
83	NC_009767	TCGC	2	8	4239	4246	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009767	GCC	2	6	4287	4292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740034
85	NC_009767	GCG	2	6	4339	4344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740034
86	NC_009767	ACC	2	6	4407	4412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740034
87	NC_009767	CGG	3	9	4417	4425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740034
88	NC_009767	GTT	2	6	4430	4435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156740034
89	NC_009767	GAC	2	6	4439	4444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740034
90	NC_009767	CAGCG	2	10	4463	4472	20 %	0 %	40 %	40 %	156740034
91	NC_009767	AGCGCC	2	12	4476	4487	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	156740034
92	NC_009767	CCG	2	6	4510	4515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740034
93	NC_009767	GTG	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740034
94	NC_009767	TCG	2	6	4620	4625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740034
95	NC_009767	CAC	2	6	4654	4659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740034
96	NC_009767	TCCC	2	8	4693	4700	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_009767	TCA	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740035
98	NC_009767	GAC	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
99	NC_009767	GC	4	8	4885	4892	0 %	0 %	50 %	50 %	156740035
100	NC_009767	GCG	2	6	4899	4904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740035
101	NC_009767	GCGGT	2	10	4919	4928	0 %	20 %	60 %	20 %	156740035
102	NC_009767	CAG	2	6	4943	4948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
103	NC_009767	GC	3	6	4996	5001	0 %	0 %	50 %	50 %	156740035
104	NC_009767	GAT	2	6	5039	5044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740035
105	NC_009767	GCT	2	6	5088	5093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740035
106	NC_009767	ACA	2	6	5130	5135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740035
107	NC_009767	TCG	2	6	5157	5162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740035
108	NC_009767	CG	3	6	5230	5235	0 %	0 %	50 %	50 %	156740035
109	NC_009767	TGC	2	6	5255	5260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740035
110	NC_009767	GC	3	6	5277	5282	0 %	0 %	50 %	50 %	156740035
111	NC_009767	GC	3	6	5363	5368	0 %	0 %	50 %	50 %	156740035
112	NC_009767	CGTC	2	8	5397	5404	0 %	25 %	25 %	50 %	156740035
113	NC_009767	GC	4	8	5475	5482	0 %	0 %	50 %	50 %	156740035
114	NC_009767	CAG	2	6	5573	5578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
115	NC_009767	ACG	2	6	5591	5596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
116	NC_009767	GCGCCA	2	12	5626	5637	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	156740035
117	NC_009767	TGC	2	6	5679	5684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740035
118	NC_009767	CGG	2	6	5705	5710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740035
119	NC_009767	GCA	2	6	5797	5802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
120	NC_009767	GC	3	6	5811	5816	0 %	0 %	50 %	50 %	156740035
121	NC_009767	ACA	2	6	5817	5822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740035
122	NC_009767	CAT	2	6	5830	5835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740035
123	NC_009767	GCC	2	6	5841	5846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740035
124	NC_009767	GGC	2	6	5872	5877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740035
125	NC_009767	CGC	2	6	5900	5905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740035
126	NC_009767	GCG	2	6	5925	5930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740035
127	NC_009767	ATCG	2	8	5960	5967	25 %	25 %	25 %	25 %	156740035
128	NC_009767	CAG	2	6	5975	5980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
129	NC_009767	CCG	2	6	6001	6006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740035
130	NC_009767	GCC	2	6	6060	6065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740035
131	NC_009767	GCA	2	6	6081	6086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
132	NC_009767	GCA	2	6	6166	6171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
133	NC_009767	CACG	2	8	6175	6182	25 %	0 %	25 %	50 %	156740035
134	NC_009767	GGA	2	6	6186	6191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156740035
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143	NC_009767	CCTG	2	8	6793	6800	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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268	NC_009767	GAT	2	6	11844	11849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740041
269	NC_009767	GCG	2	6	11914	11919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740041
270	NC_009767	CTG	2	6	11923	11928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740041
271	NC_009767	GAC	2	6	11929	11934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740041
272	NC_009767	GC	3	6	11963	11968	0 %	0 %	50 %	50 %	156740041
273	NC_009767	GC	3	6	12019	12024	0 %	0 %	50 %	50 %	156740041
274	NC_009767	TGCGC	2	10	12039	12048	0 %	20 %	40 %	40 %	156740041
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285	NC_009767	CG	3	6	12442	12447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
286	NC_009767	CGAGC	2	10	12461	12470	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
287	NC_009767	GC	3	6	12526	12531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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289	NC_009767	CG	3	6	12582	12587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
290	NC_009767	CGAGC	2	10	12601	12610	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
291	NC_009767	AGC	2	6	12676	12681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_009767	CG	3	6	12722	12727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
293	NC_009767	CGAGC	2	10	12741	12750	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
294	NC_009767	GC	3	6	12806	12811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
295	NC_009767	AGC	2	6	12816	12821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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302	NC_009767	AGC	2	6	13096	13101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
303	NC_009767	CG	3	6	13142	13147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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312	NC_009767	CG	3	6	13563	13568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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391	NC_009767	TCTT	2	8	17227	17234	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
392	NC_009767	GC	5	10	17410	17419	0 %	0 %	50 %	50 %	156740045
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400	NC_009767	GCC	2	6	17682	17687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740045
401	NC_009767	TCG	2	6	17731	17736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740045
402	NC_009767	AC	3	6	17766	17771	50 %	0 %	0 %	50 %	156740045
403	NC_009767	GCA	2	6	17784	17789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740045
404	NC_009767	GCA	2	6	17847	17852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740045
405	NC_009767	CGT	2	6	17855	17860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740045
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407	NC_009767	CTA	2	6	17917	17922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740045
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415	NC_009767	CAAA	2	8	18349	18356	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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435	NC_009767	GC	3	6	19162	19167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
436	NC_009767	GCT	2	6	19185	19190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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439	NC_009767	GC	3	6	19286	19291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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443	NC_009767	GCT	2	6	20267	20272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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452	NC_009767	AGT	2	6	21340	21345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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